华大基因app是一款由深圳华大基因科技服务有限公司发行的专注于基因的软件,该软件中是有不少的关于基因的内容。是依托于华大基因生物产业链,以基因科技造福人类为使命和愿景;提供专业可靠的遗传咨询、基因检测等与基因科技相关服务。为了让自己的后代能够有更加优异的基因天赋,能够在这里购买专业的产品进行检测,还有分析和解读。
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【近期,网络出现冒用华大基因名义的APP,发布虚假的投资信息骗取用户钱财。特此声明:华大基因官方APP从未向社会公众提供任何关于股票、股权、证券、信托或者期货等投资、融资或理财等产品、工具或服务。】
Q1:华大内部数据库PVFD和BGI-GaP是什么?
PVFD数据库在千人基因组第一阶段数据库的基础上,主要添加了东亚人群尤其是中国汉族人突变频率数据,进一步丰富东亚人群(中国人)突变频率数据。
BGI-GaP数据库包括BGI内部数据库在内的35个数据源的基因型-表型(突变-疾病)关系信息,主要是种族、地域、生活史、原始数据库名称、变异位点、变异类型、变异所在基因、疾病信息、已发表文章等信息,有助于发现特定疾病与遗传因素、健康状况、生活方式等的关系。注意:目前这两个数据库只提供SNP数据,未来升级后会添加InDel数据。
Q2:如何实现基因组变异可视化?
基因组可视化软件 IGV(Integrative Genomics Viewer)是高性能的基因组数据可视化工具,能够帮助使用者同时合并分析不同类型的基因组数据,并能灵活放大基因组上的某个特定区域。
Q3:如何寻找候选变异?
寻找候选变异位点时,可利用变异注释结果,关注非同义突变、剪接突变、移码突变。1)去除千人基因组数据库中 MAF >=1% 的变异2)去除 NHLBI-ESP6500 European American 群体数据库中 MAF >=1% 的 变异 3)去除 NHLBI-ESP6500 African American 群数据库中 MAF >=1%的变异4) 推 测 变 异 的 致 病 性 。 利 用 SIFT/PolyPhen2/Mutation assessor/Condel/FATHMM 进行打分,预测某个变异和氨基酸置换是否影响蛋白 功 能 。 如 果 score<=0.05 或 PolyPhen2>=0.909 或 MA score>=1.9 或 Condel = deleterious 或 FATHMM=deleterious,就推测该变异可能是有害变异。
Q4:SNP 筛选所使用的数据库有哪些,怎么筛选?
数据库: dbSNP 、 HapMap8、 1000 Genomes 一般情况下,我们都采用以下过滤标准: 1、质量值不低于 20; 2、覆盖深度不低于 4; 3、两个相邻 snp 之间的距离不小于 5,如果样本深度很高(>50X),可以提高过滤条件。
Q5:一般用什么方法来验证 call SNP 准确率?
华大炎黄计划是用 Sanger 测序的方法和芯片分型两种方法来验证 SNP 的准确性的, 因为 Sanger 测序被认为是测序中的金标准。
Q6:唾液采集的方法?
使用DNA Genotek公司的 Oragene•DISCOVER (OGR-500) (For Research) 或 Oragene•Dx (OGD-500) (For Diagnostics) collection kit.保存量及操作方法详见产品说明书,按照说明书操作保存运输样品。
Q7:无创dna查询
1、请下载华大基因APP,用送检单上填写的受检者手机号码注册登录成功后在我的页面,点击我的报告;2、请关注华大基因医学(D: hadad×官方微信,点击我的服务报告查询,绑定检测时登记的手机号即可查询检测结果。
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